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上海班:2019/1/12-13 (11号报到)
上海好望角饭店
学习班简介
高通量数据挖掘与分析是基于生信的方法从芯片及测序高通量数据中挖掘到与研究方向最相关的靶标基因(mRNA,miRNA,lncRNA或蛋白)。随着高通量手段的不断进步,测序和芯片的成本也逐渐降低,速度也越来越快,使用高通量手段(测序/芯片)进行科研的优点非常明显,也是大势所趋!
做过测序或者芯片实验的科研人员越来越多,虽然测序公司已经给出了一部分的数据分析,比如过滤、质控比对、定量和差异等,但是这些分析属于基础傻瓜式的标准分析,并不能完整的讲一个故事!我们也很难在大量的差异基因中筛选获得关键基因。因此,需要我们自己掌握高通量数据挖掘的能力,从海量信息中获得自己想要的关键基因!
通过该主题的学习,可以学会:
高通量公共数据的详细信息查找/下载;
在线做差异表达分析
在线blast分析
基因ID转换
通路map图制作
功能富集分析
蛋白互作分析
网络图的构建和美化。
2019/1/19-20(18号报到)
上海浦东中兴和泰酒店
培训简介:
癌症是临床医学中非常重要的疾病方向。TCGA数据库中包含了常见了40种癌症方向(含30000个样本)的高通量数据及临床信息。大家对TCGA数据库的使用近几年也在逐渐增加!如图1所示。
图1 基于 pubmed数据库检索的包含“TCGA”发表的SCI 文章数量(2018年11月7日)
关键靶标分析是指基于生信的方法从高通量数据中挖掘到与研究方向最相关的靶标基因(mRNA,miRNA,lncRNA或蛋白)。
因此,需要我们自己掌握高通量数据挖掘的能力以及逻辑性的生信分析思路,从海量信息中获得自己想要的关键基因!
培训预期:
1. 通过整整两天的培训,掌握TCGA,GEO数据库的使用、下载及分析思路和实用操作知识点。
2. 可以独立完成一篇基于公共数据库的高通量数据挖掘分析。
3. 课后还可以赠送1小时的全场串联视频,用于学员的复习。
4. 赠送一份最近5年的高价值国自然标书(医药加高价值标书库里面选择)
5. 讲师团队赠送TCGA数据库甲基化,基因表达谱整合分析报告与疾病mRNA+lncRNA分析报告
报名咨询
近期医药加学习班安排如下,如需要报名,请加学习班秘书微信yiyaojia01
1.5-6 | 北京金泰绿洲大酒店 | 光遗传膜片钳技术及该领域国自然构思写作学习班通知 |
1.5-6 | 北京金泰绿洲大酒店 | 中药网络药理学的研究策略与实用技能研讨班 |
1.5-6 | 北京金泰绿洲大酒店 | 临床预测模型构建与基于R语言统计分析学习班 |
1.4-6 | 北京金泰绿洲大酒店 | 第37期循证医学与meta分析(含网状meta分析)三天精讲学习班 |
1.12-13 | 上海好望角饭店 | 第10期测序与芯片高通量数据挖掘学习班 |
1.12-13 | 上海好望角饭店 | 肠道菌群与代谢组学国自然课题设计及研究策略专题学习班 |
1.19-20 | 上海好望角饭店 | 第八期国自然基金标书构思与撰写冲刺班 |
1.19-20 | 上海中兴和泰酒店 | TCGA/GEO高通量数据挖掘学习班 |
1.19-20 | 上海中兴和泰酒店 | 第8期医学SCI论文写作及发表技巧学习班 |
1.19-20 | 上海中兴和泰酒店 | 第28期非编码RNA与外泌体研究策略与基金申请学习班 |
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